Apoteka "Beograd" osnovana je 27. januara 1971. godine od strane Skupštine grada Beograda. U predhodnom periodu osnivač je bila Republika Srbija odnosno Ministarstvo zdravlja Republike Srbije. Zakonom o zdravstvenoj zaštiti (službeni glasnik Republike Srbije br. 107 od 02.12.2005.g.), osnivačka prava republike nad AU "Beograd" 01.01.2007.g prešla su na Skupštinu grada Beograda i došlo je do promene naziva u Apoteka "Beograd".

Tradicija apotekarstva u Beogradu datira još iz 1830. godine kada je otvorena prva privatna apoteka, čiji je vlasnik bio Mr ph Matej Ivanović. Dve najstarije apoteke, apoteka "Matej Ivanović" i apoteka "Makedonija", prva državna apoteka, predstavljaju najznačajnije spomenike beogradske i srpske farmacije koji i danas rade u okviru Apoteke "Beograd".

U apotekama, laboratoroijama i zajedničkim službama radi 1140 zaposlenih, od toga 450 diplomiranih farmaceuta, uključujući 50 specijalista iz različitih oblasti u timu sa približno 360 farmaceutskih tehičara. Podršku u radu pružaju im i visoko obrazovani stručnjaci različitih profila (pravnici, ekonomisti, inžinjeri, informatičari i dr.)